Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nckap1P28660 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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