Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hoxd10P28359 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hoxd10P28359 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hoxd10P28359 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hoxd10P28359 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hoxd10P28359 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hoxd10P28359 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hoxd10P28359 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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