Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa3P28310 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa3P28310 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa3P28310 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa3P28310 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
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