Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pde6bP23440 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pde6bP23440 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pde6bP23440 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pde6bP23440 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pde6bP23440 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pde6bP23440 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pde6bP23440 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pde6bP23440 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pde6bP23440 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pde6bP23440 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pde6bP23440 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pde6bP23440 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pde6bP23440 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pde6bP23440 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6bP23440 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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