Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NefhP19246 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NefhP19246 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NefhP19246 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NefhP19246 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NefhP19246 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NefhP19246 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NefhP19246 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NefhP19246 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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