Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RargP18911 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RargP18911 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RargP18911 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RargP18911 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RargP18911 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms