Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms