Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18533 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18533 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18533 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18533 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18533 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18533 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18533 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18533 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18533 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18533 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18533 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18533 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18533 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18533 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms