Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms