Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scd1P13516 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scd1P13516 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms