Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrm1P12657 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms