Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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DmdP11531 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DmdP11531 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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DmdP11531 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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DmdP11531 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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DmdP11531 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DmdP11531 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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DmdP11531 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DmdP11531 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DmdP11531 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DmdP11531 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DmdP11531 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DmdP11531 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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DmdP11531 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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DmdP11531 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DmdP11531 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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DmdP11531 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DmdP11531 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DmdP11531 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DmdP11531 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DmdP11531 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DmdP11531 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DmdP11531 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DmdP11531 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DmdP11531 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DmdP11531 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DmdP11531 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DmdP11531 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms