Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem254bP0DN90 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms