Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms