Protein–RNA interactions for Protein: P0C0A3

Chmp6, Charged multivesicular body protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp6P0C0A3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp6P0C0A3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms