Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf1P09925 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Surf1P09925 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Surf1P09925 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Surf1P09925 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Surf1P09925 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Surf1P09925 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf1P09925 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf1P09925 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf1P09925 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf1P09925 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf1P09925 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf1P09925 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf1P09925 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf1P09925 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf1P09925 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf1P09925 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf1P09925 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf1P09925 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf1P09925 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf1P09925 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf1P09925 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms