Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc8P09025 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms