Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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