Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TnfP06804 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TnfP06804 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnfP06804 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnfP06804 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnfP06804 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnfP06804 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms