Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04214 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04214 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04214 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04214 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04214 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04214 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04214 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04214 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04214 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04214 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04214 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04214 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04214 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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