Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01667 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01667 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01667 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01667 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01667 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01667 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01667 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01667 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01667 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P01667 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01667 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P01667 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01667 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01667 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01667 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01667 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01667 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01667 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01667 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01667 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01667 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01667 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01667 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P01667 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms