Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01653 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01653 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01653 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01653 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01653 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01653 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01653 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01653 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01653 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01653 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01653 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01653 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01653 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01653 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01653 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01653 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01653 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01653 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01653 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01653 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01653 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01653 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01653 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01653 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01653 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01653 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01653 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01653 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01653 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01653 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01653 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01653 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01653 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01653 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01653 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01653 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01653 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms