Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl2O89104 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sypl2O89104 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms