Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx8O88983 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms