Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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CcnkO88874 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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CcnkO88874 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CcnkO88874 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CcnkO88874 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnkO88874 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CcnkO88874 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CcnkO88874 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CcnkO88874 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CcnkO88874 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CcnkO88874 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CcnkO88874 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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CcnkO88874 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnkO88874 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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