Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BlmO88700 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BlmO88700 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BlmO88700 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BlmO88700 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BlmO88700 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BlmO88700 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BlmO88700 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BlmO88700 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BlmO88700 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BlmO88700 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BlmO88700 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BlmO88700 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BlmO88700 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BlmO88700 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BlmO88700 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BlmO88700 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BlmO88700 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BlmO88700 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BlmO88700 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BlmO88700 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BlmO88700 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BlmO88700 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BlmO88700 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BlmO88700 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BlmO88700 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BlmO88700 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BlmO88700 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BlmO88700 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BlmO88700 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BlmO88700 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BlmO88700 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BlmO88700 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BlmO88700 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BlmO88700 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BlmO88700 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BlmO88700 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BlmO88700 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BlmO88700 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BlmO88700 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BlmO88700 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BlmO88700 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BlmO88700 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BlmO88700 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BlmO88700 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BlmO88700 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BlmO88700 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BlmO88700 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BlmO88700 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BlmO88700 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BlmO88700 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BlmO88700 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BlmO88700 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BlmO88700 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BlmO88700 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BlmO88700 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BlmO88700 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BlmO88700 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BlmO88700 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BlmO88700 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BlmO88700 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BlmO88700 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BlmO88700 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BlmO88700 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BlmO88700 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BlmO88700 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BlmO88700 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BlmO88700 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BlmO88700 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BlmO88700 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BlmO88700 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BlmO88700 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BlmO88700 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BlmO88700 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BlmO88700 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BlmO88700 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms