Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms