Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stra6O70491 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stra6O70491 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms