Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vamp4O70480 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp4O70480 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms