Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb2O55203 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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