Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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