Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3O55013 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms