Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrxO54751 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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CrxO54751 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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CrxO54751 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrxO54751 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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CrxO54751 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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CrxO54751 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CrxO54751 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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