Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin1O54724 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms