Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Klf9O35739 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Klf9O35739 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Klf9O35739 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Klf9O35739 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms