Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Phox2bO35690 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Phox2bO35690 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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