Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-ObO35424 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms