Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Foxd2O35392 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Foxd2O35392 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Foxd2O35392 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Foxd2O35392 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Foxd2O35392 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Foxd2O35392 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Foxd2O35392 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Foxd2O35392 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Foxd2O35392 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Foxd2O35392 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Foxd2O35392 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Foxd2O35392 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Foxd2O35392 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Foxd2O35392 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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