Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Abcc1O35379 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Abcc1O35379 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Abcc1O35379 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Abcc1O35379 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Abcc1O35379 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Abcc1O35379 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Abcc1O35379 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcc1O35379 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Abcc1O35379 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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