Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

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Length 713 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn1O35350 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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