Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf11aO35305 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms