Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nedd9O35177 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nedd9O35177 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nedd9O35177 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nedd9O35177 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nedd9O35177 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Nedd9O35177 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Nedd9O35177 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Nedd9O35177 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Nedd9O35177 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nedd9O35177 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Nedd9O35177 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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