Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx3O35160 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms