Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr1aO35134 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms