Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Scarb2O35114 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Scarb2O35114 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Scarb2O35114 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scarb2O35114 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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