Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif3cO35066 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms