Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap23O09044 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snap23O09044 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms