Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec22bO08547 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sec22bO08547 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sec22bO08547 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sec22bO08547 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sec22bO08547 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec22bO08547 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec22bO08547 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec22bO08547 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec22bO08547 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sec22bO08547 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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