Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna5O08543 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna5O08543 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna5O08543 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna5O08543 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms