Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc191J3QQ27 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc191J3QQ27 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms